Journal of Animal Reproduction and Biotechnology

Table 3

Information on the genetic diversity of SNPs by chromosome

Chromosome no.	No.	MAF	PIC	He	Ho
1	31,937	0.217	0.241	0.298	0.259
2	21,843	0.216	0.241	0.297	0.253
3	25,933	0.220	0.244	0.301	0.266
4	24,733	0.220	0.243	0.301	0.257
5	25,475	0.219	0.243	0.301	0.259
6	20,828	0.219	0.243	0.300	0.256
7	22,763	0.219	0.243	0.300	0.258
8	19,208	0.223	0.246	0.305	0.266
9	15,875	0.219	0.243	0.300	0.261
10	18,085	0.217	0.241	0.298	0.259
11	18,716	0.217	0.240	0.297	0.261
12	20,783	0.220	0.244	0.302	0.262
13	18,350	0.219	0.243	0.300	0.265
14	16,690	0.219	0.243	0.300	0.263
15	16,878	0.219	0.241	0.299	0.256
16	16,390	0.220	0.243	0.300	0.261
17	18,304	0.219	0.242	0.300	0.258
18	14,985	0.219	0.243	0.300	0.247
19	14,761	0.227	0.247	0.307	0.263
20	16,080	0.214	0.238	0.294	0.253
21	14,181	0.224	0.247	0.306	0.272
22	16,767	0.219	0.243	0.300	0.268
23	15,171	0.220	0.244	0.302	0.258
24	14,097	0.223	0.246	0.304	0.267
25	14,675	0.220	0.244	0.301	0.263
26	11,329	0.225	0.247	0.306	0.264
27	13,944	0.220	0.245	0.302	0.261
28	12,594	0.220	0.245	0.303	0.258
29	12,785	0.227	0.249	0.309	0.269
30	11,689	0.220	0.243	0.301	0.258
31	12,188	0.225	0.247	0.307	0.273
32	11,998	0.223	0.245	0.304	0.255
33	9,870	0.221	0.244	0.302	0.267
34	12,269	0.233	0.254	0.315	0.270
35	9,881	0.226	0.249	0.309	0.263
36	10,204	0.219	0.242	0.299	0.266
37	10,183	0.211	0.237	0.292	0.254
38	9,230	0.220	0.243	0.300	0.255
Total	621,672	0.220	0.244	0.301	0.261

GD, genetic diversity; MAF, minor allele frequency; PIC, polymorphic information content; He, expected heterozygosity; Ho, observed heterozygosity.

Journal of Animal Reproduction and Biotechnology 2024;39:138-44 https://doi.org/10.12750/JARB.39.2.138