JARB Journal of Animal Reproduction and Biotehnology

OPEN ACCESS pISSN: 2671-4639
eISSN: 2671-4663

Table. 3.

Results of genetic diversity analysis of SNPs associated with primary angle closure glaucoma

No. SNP ID rs number MAF He Ho PIC
1 AX-167217422 rs23976401 0.07 0.14 0.15 0.13
2 AX-168246902 rs852876458 0.12 0.20 0.17 0.18
3 AX-168210919 rs851491018 0.16 0.27 0.24 0.23
4 AX-167847910* rs23984491 0.41 0.48 0.39 0.37
5 AX-167801462 rs851538845 0.16 0.27 0.21 0.23
6 AX-167184748* rs24001495 0.34 0.45 0.41 0.35
7 AX-167846951 rs852237270 0.05 0.09 0.09 0.09
8 AX-168147206 rs23982463 0.04 0.08 0.06 0.08
9 AX-167810094 rs852110940 0.10 0.17 0.15 0.16
10 AX-167991793 rs852370128 0.26 0.38 0.30 0.31
11 AX-168273159 rs853185625 0.06 0.12 0.09 0.11
12 AX-167194690 rs23998390 0.10 0.19 0.16 0.17
13 AX-167823767 rs23998393 0.06 0.11 0.07 0.1
14 AX-167637581* rs851382779 0.48 0.50 0.42 0.37
15 AX-167985585 rs24039264 0.19 0.31 0.24 0.26
16 AX-167217114* rs23979462 0.38 0.47 0.32 0.36
17 AX-167404809 rs23986466 0.24 0.36 0.31 0.30
18 AX-167404447 rs23986562 0.09 0.16 0.14 0.15
19 AX-167897987 rs851343494 0.09 0.16 0.14 0.15
20 AX-167841912 rs23986640 0.13 0.23 0.16 0.2
21 AX-167383510* rs24025679 0.48 0.50 0.39 0.37
22 AX-167923340 rs24025685 0.11 0.19 0.13 0.17
23 AX-168066391* rs851371034 0.45 0.50 0.40 0.37
24 AX-167604917* rs851223555 0.48 0.50 0.32 0.37
25 AX-167320296 rs24025719 0.09 0.17 0.15 0.16
26 AX-167172236 rs23978879 0.29 0.41 0.28 0.33
27 AX-168050101 rs23989983 0.07 0.14 0.13 0.13
28 AX-168174642* rs8731074 0.45 0.50 0.36 0.37
29 AX-167396835* rs24025767 0.34 0.45 0.33 0.35
30 AX-167797246 rs850592213 0.21 0.33 0.22 0.27
31 AX-167816257 rs24025768 0.22 0.35 0.26 0.29
32 AX-167569583* rs24025787 0.41 0.48 0.35 0.37
33 AX-167694666 rs23962988 0.12 0.20 0.15 0.18
34 AX-167619949* rs9220269 0.31 0.42 0.34 0.33
35 AX-167662205 rs8803780 0.11 0.20 0.16 0.18
36 AX-168148502* rs24025842 0.31 0.42 0.29 0.33
37 AX-167198755* rs24025844 0.42 0.49 0.43 0.37
38 AX-167497274 rs24025861 0.24 0.37 0.28 0.30
39 AX-167826614 rs24025878 0.20 0.31 0.22 0.27
40 AX-167242351* rs24025886 0.46 0.50 0.34 0.37
41 AX-168092155 rs9118158 0.19 0.31 0.19 0.26
42 AX-167553235 rs23992915 0.26 0.38 0.28 0.31
43 AX-168011825 rs23975180 0.28 0.41 0.34 0.32
44 AX-167651967* rs8523148 0.42 0.49 0.33 0.37
45 AX-167227442 rs9080203 0.22 0.34 0.28 0.28
46 AX-167747971 rs852540802 0.15 0.25 0.23 0.22
47 AX-167651717* rs23967376 0.39 0.48 0.4 0.36
48 AX-167724356 rs23967416 0.23 0.35 0.28 0.29
49 AX-167639625* rs23991372 0.47 0.5 0.43 0.37
50 AX-167199290* rs23962261 0.32 0.43 0.46 0.34
51 AX-167933210 rs851921536 0.05 0.09 0.07 0.09
52 AX-168088678 rs850873816 0.04 0.07 0.05 0.07
53 AX-167215217* rs23967454 0.32 0.43 0.29 0.34
54 AX-167361648* rs23982770 0.36 0.46 0.39 0.36
55 AX-167702138 rs23982772 0.17 0.29 0.26 0.25
56 AX-167948469 rs23999265 0.19 0.3 0.24 0.26
57 AX-167913500* rs851530134 0.36 0.46 0.48 0.35
58 AX-167410376 rs23961325 0.22 0.34 0.33 0.28
59 AX-167669027 rs9033620 0.21 0.33 0.32 0.28
60 AX-167667318 rs850779465 0.21 0.33 0.31 0.27
61 AX-167913149* rs23995410 0.39 0.48 0.4 0.36
62 AX-168247394 rs9232790 0.14 0.24 0.23 0.21
63 AX-167855288* rs23968050 0.42 0.49 0.44 0.37
64 AX-167527485 rs23999120 0.22 0.34 0.31 0.28
65 AX-167546901* rs852082637 0.32 0.43 0.36 0.34
Mean 0.24 0.33 0.27 0.27

MAF, minor allele frequency; He, expected heterozygosity; Ho, observed heterozygosity; PIC, polymorphic information content. *SNPs with high genetic diversity.
Journal of Animal Reproduction and Biotechnology 2024;39:294-304 https://doi.org/10.12750/JARB.39.4.294